Het doel van de Federatie is een platform te zijn voor en van de gemeenten om zodoende:

• Gods opdracht goed in beeld te houden;
• Elkaar tot steun te zijn in geestelijke en praktische zaken;
• Ontwikkelingen in de gemeenten te kunnen uitwisselen;
• Activiteiten te kunnen initiëren;
• Te helpen bij het uitvoeren van activiteiten die alle gemeenten aangaan, zoals opleidingen, Zendtijd voor Kerken, zending enzovoorts

De Federatie probeert haar doelen te bereiken door onder andere:

• Het houden van een voor- en najaarsvergadering;
• Het aanbieden van een eigen kerkelijke variant bij de GPW-opleiding van de Christelijke Hogeschool Ede;
• De instelling van een curatorium;
• De vaststelling van normen voor predikanten en voorgangers;
• Aansluiting bij de Zendtijd voor Kerken, in het bijzonder bij de Zendtijd Evangelische Gemeenten.